崇祯六年二月初二,李云崖和朱由检在新建成的太和宫里面召开大朝会。
因李云崖让朱由检放权，皇帝只管军队、外交和监督,平时在北海办公,其余各部会归内阁管辖,主要在南海办公，每年只在年初、年中、年末三次,各部会全部聚集到中海，在这座九层高的太和宫里面开大朝会。
太和宫是专门用来开会的地方，最顶层的会议室能够同时容纳三百人，李云崖首先上主席台,做重要发言，用了十分钟讲完，然后请朱由检上台讲话。
这几天两人都在昭和宫里面研究,在李云崖的帮助下，朱由检写了整整二十七页的纸，都是密密麻麻的钢笔字而非毛笔字,他坐上主席台之后，说的给卢象升。
孙承宗对于辽东的策略就是步步为营反客为主，野战打不过满清就不停地筑城，把防御塔修到敌人家门口，孙承宗调回中央之后，卢象升在初步改编完辽东军之后，继续筑城，跟原来的历史上不同的是，此时明军战斗力强大，清军却因为崇祯二年那场战争元气大伤，卢象升打起仗来有板有眼，稳重又不失锐气，在朱由检改革税制以后，拿到了充足的银子，筑起城来更起劲了。
去年七月的时候，他派祖大寿到大凌河畔筑城，这里距离满清首都的沈阳直线距离也才三百多里，骑兵快马奔袭，一日夜就能杀到，再往前走就要修到沈阳了！而且此城在锦州以东，要打锦州必先打此城，要打此城必先打锦州，互成掎角之势，皇太极自然不能坐视不理，调集大量满蒙八旗杀过来，将祖大寿困住。
卢象升早料到此城一修，皇太极会出兵来打，提前给祖大寿调了一百门野战炮和两百架迫击炮，以及充足的弹药，让他死守，自己亲自率领三万新组建的陷阵营出锦州城和祖大寿配合，跟皇太极鏖战，这两年皇太极也造出了火|枪，还造了大炮，不过都还停留在火绳阶段，大炮也是用火药发射实心铁球的那种，由于冶金技术不行，又极为笨重，但总算能固守阵地。
双方乒乒乓乓打了大半天，忽然皇太极得到急报，曹变蛟率领两万贪狼骑已经绕道直取沈阳，半路上接战十六股清军，全部都是一举击溃，皇太极大吃一惊，急忙以步兵断后，骑兵先行回防，且战且退，卢象升率兵随后掩杀，大获全胜。
朱由检以此战功，授卢象升为上校军衔，曹变蛟为少校，李云崖设计的这套军衔系统，只授予给军校出身的人，李云崖订下的规矩，凡是军校出身的人不受外面的人指挥，卢象升改编辽东军之后，不少将官都到北京军校受训，最少一年，分批分期过来，像祖大寿、吴襄等都没有受训过，指挥得还是比较老的军队，关宁铁骑被卢象升拆分，他们剩下的都是淘汰下来的，朱由检给这些人封赏，则按照原来那一套守备、游击、总兵。
两套军制并行，但明眼人谁都看得出来，新军体制才更占主流，于是越来越多的将官都主动申请到北京接受训练。
为了彻底解决地方军阀指挥不灵的问题，去年朝会上，朱由检给吴襄封了破虏将军，调回北京归家养老，他儿子吴三桂已经是一个司令了，不能再让他在另外一支军队里掌握军权，明朝的将军还是很值钱的，给他一个将军衔，让他光荣退休，按照少将的待遇给退休金，也算对得起他大半辈子戍守辽东为国打拼了，当然，他过去贪污搜刮的土地全被被收归国有，钱财地产捐出来三分之二，剩下的也够他潇潇洒洒活完一生了。
朱由检是个很聪明的人，也很会玩帝王之术，这些事情都是他自己做出的规划，强制吴襄归家之后，再把祖大寿调往山西，到孙传庭帐下听令，整个辽东军就彻底被掌握在政府手里，卢象升共整编了十个师团，约十二万人，其中两万贪狼骑兵，三万陷阵营，五万常规兵，跟满清野战已经不再落于下风，现在只是双方谁也灭不了谁，就那么对峙着，卢象升每隔一段时间就筑一座城，经过去年那一场大败，皇太极已经在研究迁都了，琢磨着要不要把都城迁到长春去。
西北战区孙传庭那里也搞得有声有色，高迎祥败回山西之后，留下了几十万的流民，被李云崖带回北京有二十多万，就地消化二十多万，孙传庭从中挑选青壮，整编了六个师团，约九万人，其中一万破军营，两万虎步营，都由孙传庭直接率领，另有五万常规军，除了驻扎在黄河潼关一线，还有北边的宣府大同一代，要防着蒙古。
北京军区的七杀卫也重新扩增到三万，由吴三桂率领，北方地区已经万无一失，李云崖未雨绸缪，建议防备东南，于是新成立南京军区，由满桂任总司令，统领两万陆军，一万水兵，势力沿长江一带，坐镇江浙湖广。另设立广州军区，由曹变蛟任总司令，统兵五万，其中三万是海军，为将来攻略东南亚做准备。
朱由检给国防部规定了一个新的任务：“各军区成立起来以后，就要开始剿匪，凡流寇、山匪、水贼等，一律剿灭，五年之后，各军区境内不得再有二十人以上的匪患！”至于二人以下的，由李云崖敦促公安部追剿，只有治安好了，工商业才能发达，工商业流通起来，国家才能富强。
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